C'est en 1891 que s'est installée l'idée de créer ce musée à Alexandrie, et il ne fut inauguré que le 17 octobre 1892.

La majorité des collections existantes dans le musée datent du 3ème siècle av.J.C. Ces collections ont été répertoriées et placées dans 27 chambres.. Quelques monuments se trouvent dans le petit jardin.

Quelques possessions du musée :

- Une devise byzantine en bronze datant du règne de Héracles (610 à 640 ap.J.C) frappée à Alexandrie. La devise porte sur une de ses faces la croix à deux degrés et la lettre grecque S qui désigne le chiffre 6.

- Une statue en marbre d'Osiris canope sous forme de récipient. Osiris était le dieu local de la ville de Canope (la ville de Aboukir à l'est d'Alexandrie). Le couvercle du récipient a la forme de la tête d'Osiris le dieu égyptien, alors que le corps du récipient à la forme du canope qui renfermait les viscères du mort.

 Le récipient est décoré de dessins en relief représentant Harpocrate et Isis. Deux vautours se tiennent au-dessus du sarcophage, alors que le dieu Harpocrate paraît portant le signe de la vie Ankh et suivi de la déesse Isis.

- Statue du bon pasteur : La statue représente un jeune homme endormi sur une base carrée. Il porte sur son dos un agneau qu'il tient mains, avec sa main droite, alors que dans sa main gauche un baton. A ses pieds se trouvent deux jeunes agneaux qui le regardent.

- Statue du prêtre Irianus : Cette statue sculptée dans du Bazalt noir représente le prêtre se tenant debout sur une base.. selon le style égyptien traditionnel.

- Un joyau décoré, rectangulaire et aplatie.. sur lequel est gravé le profil d'un oiseau, surmonté de trois fleurs, à la base se trouve une seule fleur.

- Les restes d'une tête en marbre blanc d'Alexandre le grand sculptée selon le style grec. La tête a perdu le nez et le menton.

Mosaïque de la seconde reine Berniki :
Cette toile représente la reine Berniki la 2ème épouse de Ptolémée III. Sa tête est surmontée de la croupe d'une barque, symbole de la puissance maritime du règne des Ptolémées.

Le visage de la reine apparaît plein, le front large et un peu bas.les yeux protubérants et brillants, le nez grand et droit, les lèvres pleines, la bouche petite.La statue est signée par l'artiste grec Sofilos.

Socle représentant le pied de Isidros :
Ce socle a été sculpté en marbre pour présenter le pied de Isidros. Il porte 9 lignes grecques gravées en rouge . Ses sandales de style romain surnommé Calcins Patrix, dénotent la place sociale élevée de Isidros.

Une pièce servant de garniture représentant une couronne entourée d'un cadre d'écriture épaisse en relief. A l'intérieur du cadre, deux oiseaux sont gravés en creux, en se tenant vis à vis l'un de l'autre.

Leurs becs sont ouverts comme s'ils s'échangeaient la parole.
Un disque paraît entre les deux oiseaux.. Cette pièce renferme cinq trous, dont trois se trouvent dans le coin gauche supérieur et pourront la relier à quelque chose.