Está situado en un palacio restaurado de estilo italiano, próximo al centro de la ciudad. Contiene unos 1.800 objetos, que describen la historia de Alejandría y Egipto. Muchas piezas provienen de otros museos egipcios.

- Planta 1:

Época faraónica: Las momias se muestran en una recreación de una cámara funeraria.

- Planta 2:

Época grecorromana: Incluye piezas halladas en excavaciones arqueológicas submarinas del mar alejandrino.

- Planta 3:

Época copta, árabe (abasíes, omeyas, fatimís...) y siglos XIX y XX.